Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA4

MTMR4, Myotubularin-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR4Q9NYA4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MTMR4Q9NYA4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MTMR4Q9NYA4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms