Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK13-1Q9NX77 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK13-1Q9NX77 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK13-1Q9NX77 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK13-1Q9NX77 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK13-1Q9NX77 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK13-1Q9NX77 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK13-1Q9NX77 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK13-1Q9NX77 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK13-1Q9NX77 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK13-1Q9NX77 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK13-1Q9NX77 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK13-1Q9NX77 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK13-1Q9NX77 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK13-1Q9NX77 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK13-1Q9NX77 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK13-1Q9NX77 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK13-1Q9NX77 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK13-1Q9NX77 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK13-1Q9NX77 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK13-1Q9NX77 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK13-1Q9NX77 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK13-1Q9NX77 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK13-1Q9NX77 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK13-1Q9NX77 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK13-1Q9NX77 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK13-1Q9NX77 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK13-1Q9NX77 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK13-1Q9NX77 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK13-1Q9NX77 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ERVK13-1Q9NX77 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK13-1Q9NX77 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK13-1Q9NX77 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK13-1Q9NX77 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK13-1Q9NX77 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK13-1Q9NX77 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK13-1Q9NX77 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK13-1Q9NX77 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK13-1Q9NX77 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK13-1Q9NX77 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK13-1Q9NX77 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK13-1Q9NX77 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK13-1Q9NX77 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK13-1Q9NX77 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK13-1Q9NX77 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK13-1Q9NX77 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK13-1Q9NX77 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK13-1Q9NX77 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK13-1Q9NX77 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK13-1Q9NX77 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ERVK13-1Q9NX77 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK13-1Q9NX77 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK13-1Q9NX77 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK13-1Q9NX77 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK13-1Q9NX77 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK13-1Q9NX77 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK13-1Q9NX77 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK13-1Q9NX77 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK13-1Q9NX77 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK13-1Q9NX77 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK13-1Q9NX77 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK13-1Q9NX77 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK13-1Q9NX77 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK13-1Q9NX77 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK13-1Q9NX77 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ERVK13-1Q9NX77 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ERVK13-1Q9NX77 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
ERVK13-1Q9NX77 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms