Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX18

SDHAF2, Succinate dehydrogenase assembly factor 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF2Q9NX18 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SDHAF2Q9NX18 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms