Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVP2

ASF1B, Histone chaperone ASF1B, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASF1BQ9NVP2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ASF1BQ9NVP2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms