Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FBXO28Q9NVF7 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
FBXO28Q9NVF7 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms