Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GINM1Q9NU53 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GINM1Q9NU53 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms