Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATG3Q9NT62 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ATG3Q9NT62 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATG3Q9NT62 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATG3Q9NT62 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATG3Q9NT62 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATG3Q9NT62 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATG3Q9NT62 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATG3Q9NT62 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATG3Q9NT62 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATG3Q9NT62 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATG3Q9NT62 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATG3Q9NT62 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATG3Q9NT62 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATG3Q9NT62 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ATG3Q9NT62 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATG3Q9NT62 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATG3Q9NT62 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATG3Q9NT62 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
ATG3Q9NT62 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATG3Q9NT62 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATG3Q9NT62 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ATG3Q9NT62 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATG3Q9NT62 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATG3Q9NT62 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATG3Q9NT62 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATG3Q9NT62 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATG3Q9NT62 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATG3Q9NT62 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATG3Q9NT62 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ATG3Q9NT62 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ATG3Q9NT62 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATG3Q9NT62 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATG3Q9NT62 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ATG3Q9NT62 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATG3Q9NT62 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATG3Q9NT62 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATG3Q9NT62 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATG3Q9NT62 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATG3Q9NT62 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
ATG3Q9NT62 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATG3Q9NT62 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATG3Q9NT62 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATG3Q9NT62 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATG3Q9NT62 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATG3Q9NT62 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ATG3Q9NT62 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATG3Q9NT62 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATG3Q9NT62 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ATG3Q9NT62 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATG3Q9NT62 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATG3Q9NT62 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
ATG3Q9NT62 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATG3Q9NT62 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATG3Q9NT62 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATG3Q9NT62 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATG3Q9NT62 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATG3Q9NT62 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATG3Q9NT62 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATG3Q9NT62 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ATG3Q9NT62 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATG3Q9NT62 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATG3Q9NT62 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATG3Q9NT62 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATG3Q9NT62 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATG3Q9NT62 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATG3Q9NT62 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATG3Q9NT62 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATG3Q9NT62 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATG3Q9NT62 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATG3Q9NT62 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ATG3Q9NT62 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATG3Q9NT62 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATG3Q9NT62 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATG3Q9NT62 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATG3Q9NT62 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATG3Q9NT62 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATG3Q9NT62 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
ATG3Q9NT62 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ATG3Q9NT62 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ATG3Q9NT62 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATG3Q9NT62 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
ATG3Q9NT62 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATG3Q9NT62 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATG3Q9NT62 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ATG3Q9NT62 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATG3Q9NT62 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATG3Q9NT62 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATG3Q9NT62 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATG3Q9NT62 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATG3Q9NT62 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATG3Q9NT62 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATG3Q9NT62 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATG3Q9NT62 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATG3Q9NT62 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATG3Q9NT62 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATG3Q9NT62 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ATG3Q9NT62 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATG3Q9NT62 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ATG3Q9NT62 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms