Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC30.41■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.4■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC30.39■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC30.39■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
RRP7BPQ9NSQ0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.45
RRP7BPQ9NSQ0 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RRP7BPQ9NSQ0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
RRP7BPQ9NSQ0 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RRP7BPQ9NSQ0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
RRP7BPQ9NSQ0 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
RRP7BPQ9NSQ0 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC30.38■■■□□ 2.45
RRP7BPQ9NSQ0 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RRP7BPQ9NSQ0 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RRP7BPQ9NSQ0 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC30.38■■■□□ 2.45
RRP7BPQ9NSQ0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
RRP7BPQ9NSQ0 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
RRP7BPQ9NSQ0 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RRP7BPQ9NSQ0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
RRP7BPQ9NSQ0 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
RRP7BPQ9NSQ0 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
RRP7BPQ9NSQ0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
RRP7BPQ9NSQ0 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RRP7BPQ9NSQ0 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
RRP7BPQ9NSQ0 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
RRP7BPQ9NSQ0 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
RRP7BPQ9NSQ0 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
RRP7BPQ9NSQ0 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
RRP7BPQ9NSQ0 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
RRP7BPQ9NSQ0 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
RRP7BPQ9NSQ0 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
RRP7BPQ9NSQ0 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
RRP7BPQ9NSQ0 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC30.36■■■□□ 2.45
RRP7BPQ9NSQ0 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
RRP7BPQ9NSQ0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RRP7BPQ9NSQ0 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RRP7BPQ9NSQ0 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RRP7BPQ9NSQ0 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RRP7BPQ9NSQ0 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RRP7BPQ9NSQ0 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RRP7BPQ9NSQ0 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RRP7BPQ9NSQ0 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RRP7BPQ9NSQ0 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
RRP7BPQ9NSQ0 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RRP7BPQ9NSQ0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
RRP7BPQ9NSQ0 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RRP7BPQ9NSQ0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RRP7BPQ9NSQ0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
RRP7BPQ9NSQ0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms