Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRB3

CHST12, Carbohydrate sulfotransferase 12, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST12Q9NRB3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CHST12Q9NRB3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHST12Q9NRB3 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHST12Q9NRB3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHST12Q9NRB3 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHST12Q9NRB3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHST12Q9NRB3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHST12Q9NRB3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHST12Q9NRB3 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHST12Q9NRB3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHST12Q9NRB3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHST12Q9NRB3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHST12Q9NRB3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CHST12Q9NRB3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHST12Q9NRB3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHST12Q9NRB3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHST12Q9NRB3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CHST12Q9NRB3 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHST12Q9NRB3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHST12Q9NRB3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHST12Q9NRB3 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CHST12Q9NRB3 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHST12Q9NRB3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHST12Q9NRB3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHST12Q9NRB3 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHST12Q9NRB3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHST12Q9NRB3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHST12Q9NRB3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHST12Q9NRB3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHST12Q9NRB3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHST12Q9NRB3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CHST12Q9NRB3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHST12Q9NRB3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHST12Q9NRB3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms