Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR12

PDLIM7, PDZ and LIM domain protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM7Q9NR12 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PDLIM7Q9NR12 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PDLIM7Q9NR12 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms