Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ASCL3Q9NQ33 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms