Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP58

ABCB6, ATP-binding cassette sub-family B member 6, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB6Q9NP58 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ABCB6Q9NP58 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ABCB6Q9NP58 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms