Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
APOBEC3GQ9HC16 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APOBEC3GQ9HC16 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms