Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
UPF2Q9HAU5 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UPF2Q9HAU5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UPF2Q9HAU5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UPF2Q9HAU5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UPF2Q9HAU5 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UPF2Q9HAU5 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UPF2Q9HAU5 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UPF2Q9HAU5 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UPF2Q9HAU5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UPF2Q9HAU5 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
UPF2Q9HAU5 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
UPF2Q9HAU5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UPF2Q9HAU5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UPF2Q9HAU5 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UPF2Q9HAU5 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UPF2Q9HAU5 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UPF2Q9HAU5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UPF2Q9HAU5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UPF2Q9HAU5 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UPF2Q9HAU5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
UPF2Q9HAU5 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UPF2Q9HAU5 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
UPF2Q9HAU5 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UPF2Q9HAU5 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UPF2Q9HAU5 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
UPF2Q9HAU5 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
UPF2Q9HAU5 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
UPF2Q9HAU5 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms