Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NRDE2Q9H7Z3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NRDE2Q9H7Z3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms