Protein–RNA interactions for Protein: Q9H015

SLC22A4, Solute carrier family 22 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A4Q9H015 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC22A4Q9H015 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC22A4Q9H015 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC22A4Q9H015 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC22A4Q9H015 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC22A4Q9H015 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC22A4Q9H015 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC22A4Q9H015 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC22A4Q9H015 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC22A4Q9H015 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC22A4Q9H015 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC22A4Q9H015 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC22A4Q9H015 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC22A4Q9H015 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC22A4Q9H015 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC22A4Q9H015 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC22A4Q9H015 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SLC22A4Q9H015 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC22A4Q9H015 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC22A4Q9H015 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC22A4Q9H015 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC22A4Q9H015 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC22A4Q9H015 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC22A4Q9H015 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC22A4Q9H015 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC22A4Q9H015 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC22A4Q9H015 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC22A4Q9H015 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC22A4Q9H015 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC22A4Q9H015 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC22A4Q9H015 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC22A4Q9H015 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC22A4Q9H015 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC22A4Q9H015 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC22A4Q9H015 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC22A4Q9H015 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC22A4Q9H015 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC22A4Q9H015 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC22A4Q9H015 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC22A4Q9H015 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC22A4Q9H015 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC22A4Q9H015 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC22A4Q9H015 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC22A4Q9H015 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SLC22A4Q9H015 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC22A4Q9H015 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SLC22A4Q9H015 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SLC22A4Q9H015 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms