Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRRCC1Q9C099 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms