Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYS8

LRRC2, Leucine-rich repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC2Q9BYS8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC2Q9BYS8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC2Q9BYS8 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC2Q9BYS8 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC2Q9BYS8 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC2Q9BYS8 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC2Q9BYS8 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC2Q9BYS8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRRC2Q9BYS8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRRC2Q9BYS8 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRRC2Q9BYS8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRRC2Q9BYS8 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LRRC2Q9BYS8 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms