Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE9

CDHR2, Cadherin-related family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDHR2Q9BYE9 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CDHR2Q9BYE9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDHR2Q9BYE9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDHR2Q9BYE9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDHR2Q9BYE9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDHR2Q9BYE9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDHR2Q9BYE9 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDHR2Q9BYE9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms