Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWC9

CCDC106, Coiled-coil domain-containing protein 106, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC106Q9BWC9 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC106Q9BWC9 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC106Q9BWC9 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC106Q9BWC9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC106Q9BWC9 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC106Q9BWC9 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC106Q9BWC9 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC106Q9BWC9 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC106Q9BWC9 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC106Q9BWC9 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC106Q9BWC9 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC106Q9BWC9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC106Q9BWC9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC106Q9BWC9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC106Q9BWC9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC106Q9BWC9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC106Q9BWC9 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC106Q9BWC9 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC106Q9BWC9 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC106Q9BWC9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC106Q9BWC9 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC106Q9BWC9 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC106Q9BWC9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC106Q9BWC9 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC106Q9BWC9 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC106Q9BWC9 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC106Q9BWC9 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC106Q9BWC9 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC106Q9BWC9 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC106Q9BWC9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC106Q9BWC9 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC106Q9BWC9 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC106Q9BWC9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC106Q9BWC9 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC106Q9BWC9 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC106Q9BWC9 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC106Q9BWC9 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC106Q9BWC9 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC106Q9BWC9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC106Q9BWC9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC106Q9BWC9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC106Q9BWC9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC106Q9BWC9 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC106Q9BWC9 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC106Q9BWC9 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC106Q9BWC9 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC106Q9BWC9 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC106Q9BWC9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC106Q9BWC9 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC106Q9BWC9 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC106Q9BWC9 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC106Q9BWC9 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC106Q9BWC9 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC106Q9BWC9 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC106Q9BWC9 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC106Q9BWC9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC106Q9BWC9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
CCDC106Q9BWC9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CCDC106Q9BWC9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms