Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVG4

PBDC1, Protein PBDC1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBDC1Q9BVG4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PBDC1Q9BVG4 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PBDC1Q9BVG4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms