Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSV6

TSEN34, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen34, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSEN34Q9BSV6 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TSEN34Q9BSV6 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TSEN34Q9BSV6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms