Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE5

AGMAT, Agmatinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGMATQ9BSE5 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AGMATQ9BSE5 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
AGMATQ9BSE5 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
AGMATQ9BSE5 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AGMATQ9BSE5 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AGMATQ9BSE5 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AGMATQ9BSE5 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AGMATQ9BSE5 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AGMATQ9BSE5 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AGMATQ9BSE5 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
AGMATQ9BSE5 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AGMATQ9BSE5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AGMATQ9BSE5 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AGMATQ9BSE5 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
AGMATQ9BSE5 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AGMATQ9BSE5 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AGMATQ9BSE5 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
AGMATQ9BSE5 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AGMATQ9BSE5 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AGMATQ9BSE5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AGMATQ9BSE5 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AGMATQ9BSE5 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AGMATQ9BSE5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AGMATQ9BSE5 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AGMATQ9BSE5 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AGMATQ9BSE5 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AGMATQ9BSE5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AGMATQ9BSE5 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
AGMATQ9BSE5 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AGMATQ9BSE5 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
AGMATQ9BSE5 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AGMATQ9BSE5 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AGMATQ9BSE5 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AGMATQ9BSE5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AGMATQ9BSE5 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AGMATQ9BSE5 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AGMATQ9BSE5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AGMATQ9BSE5 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AGMATQ9BSE5 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AGMATQ9BSE5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AGMATQ9BSE5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AGMATQ9BSE5 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AGMATQ9BSE5 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AGMATQ9BSE5 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AGMATQ9BSE5 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AGMATQ9BSE5 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AGMATQ9BSE5 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AGMATQ9BSE5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
AGMATQ9BSE5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
AGMATQ9BSE5 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AGMATQ9BSE5 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AGMATQ9BSE5 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AGMATQ9BSE5 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AGMATQ9BSE5 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AGMATQ9BSE5 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AGMATQ9BSE5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AGMATQ9BSE5 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AGMATQ9BSE5 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AGMATQ9BSE5 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
AGMATQ9BSE5 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AGMATQ9BSE5 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AGMATQ9BSE5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AGMATQ9BSE5 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AGMATQ9BSE5 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AGMATQ9BSE5 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AGMATQ9BSE5 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AGMATQ9BSE5 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AGMATQ9BSE5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AGMATQ9BSE5 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AGMATQ9BSE5 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
AGMATQ9BSE5 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
AGMATQ9BSE5 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
AGMATQ9BSE5 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
AGMATQ9BSE5 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AGMATQ9BSE5 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AGMATQ9BSE5 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
AGMATQ9BSE5 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
AGMATQ9BSE5 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AGMATQ9BSE5 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AGMATQ9BSE5 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AGMATQ9BSE5 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AGMATQ9BSE5 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AGMATQ9BSE5 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AGMATQ9BSE5 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
AGMATQ9BSE5 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
AGMATQ9BSE5 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AGMATQ9BSE5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AGMATQ9BSE5 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AGMATQ9BSE5 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AGMATQ9BSE5 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AGMATQ9BSE5 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AGMATQ9BSE5 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AGMATQ9BSE5 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AGMATQ9BSE5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AGMATQ9BSE5 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AGMATQ9BSE5 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
AGMATQ9BSE5 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
AGMATQ9BSE5 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
AGMATQ9BSE5 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
AGMATQ9BSE5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms