Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ70

TCF25, Transcription factor 25, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF25Q9BQ70 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCF25Q9BQ70 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCF25Q9BQ70 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCF25Q9BQ70 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TCF25Q9BQ70 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCF25Q9BQ70 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCF25Q9BQ70 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCF25Q9BQ70 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCF25Q9BQ70 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCF25Q9BQ70 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCF25Q9BQ70 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCF25Q9BQ70 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCF25Q9BQ70 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TCF25Q9BQ70 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCF25Q9BQ70 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCF25Q9BQ70 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TCF25Q9BQ70 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCF25Q9BQ70 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCF25Q9BQ70 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCF25Q9BQ70 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCF25Q9BQ70 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCF25Q9BQ70 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCF25Q9BQ70 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCF25Q9BQ70 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCF25Q9BQ70 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCF25Q9BQ70 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCF25Q9BQ70 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCF25Q9BQ70 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCF25Q9BQ70 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCF25Q9BQ70 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCF25Q9BQ70 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCF25Q9BQ70 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCF25Q9BQ70 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TCF25Q9BQ70 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCF25Q9BQ70 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCF25Q9BQ70 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCF25Q9BQ70 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCF25Q9BQ70 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCF25Q9BQ70 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCF25Q9BQ70 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCF25Q9BQ70 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TCF25Q9BQ70 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCF25Q9BQ70 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCF25Q9BQ70 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCF25Q9BQ70 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCF25Q9BQ70 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCF25Q9BQ70 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
TCF25Q9BQ70 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCF25Q9BQ70 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCF25Q9BQ70 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCF25Q9BQ70 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TCF25Q9BQ70 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCF25Q9BQ70 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCF25Q9BQ70 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCF25Q9BQ70 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCF25Q9BQ70 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCF25Q9BQ70 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCF25Q9BQ70 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCF25Q9BQ70 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCF25Q9BQ70 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCF25Q9BQ70 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCF25Q9BQ70 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCF25Q9BQ70 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCF25Q9BQ70 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
TCF25Q9BQ70 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCF25Q9BQ70 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCF25Q9BQ70 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCF25Q9BQ70 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCF25Q9BQ70 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCF25Q9BQ70 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCF25Q9BQ70 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TCF25Q9BQ70 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCF25Q9BQ70 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCF25Q9BQ70 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCF25Q9BQ70 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCF25Q9BQ70 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCF25Q9BQ70 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCF25Q9BQ70 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCF25Q9BQ70 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCF25Q9BQ70 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCF25Q9BQ70 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCF25Q9BQ70 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCF25Q9BQ70 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCF25Q9BQ70 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCF25Q9BQ70 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCF25Q9BQ70 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCF25Q9BQ70 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TCF25Q9BQ70 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCF25Q9BQ70 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCF25Q9BQ70 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCF25Q9BQ70 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCF25Q9BQ70 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCF25Q9BQ70 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCF25Q9BQ70 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCF25Q9BQ70 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCF25Q9BQ70 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCF25Q9BQ70 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCF25Q9BQ70 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCF25Q9BQ70 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TCF25Q9BQ70 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms