Protein–RNA interactions for Protein: Q99496

RNF2, E3 ubiquitin-protein ligase RING2, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF2Q99496 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF2Q99496 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF2Q99496 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF2Q99496 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF2Q99496 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF2Q99496 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF2Q99496 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF2Q99496 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF2Q99496 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF2Q99496 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF2Q99496 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF2Q99496 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF2Q99496 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF2Q99496 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF2Q99496 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF2Q99496 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF2Q99496 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF2Q99496 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF2Q99496 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF2Q99496 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF2Q99496 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF2Q99496 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF2Q99496 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF2Q99496 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF2Q99496 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF2Q99496 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF2Q99496 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF2Q99496 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RNF2Q99496 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF2Q99496 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF2Q99496 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF2Q99496 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF2Q99496 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF2Q99496 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF2Q99496 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF2Q99496 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF2Q99496 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF2Q99496 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF2Q99496 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF2Q99496 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF2Q99496 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF2Q99496 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF2Q99496 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF2Q99496 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF2Q99496 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF2Q99496 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF2Q99496 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF2Q99496 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF2Q99496 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF2Q99496 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF2Q99496 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RNF2Q99496 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC16■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
RNF2Q99496 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms