Protein–RNA interactions for Protein: Q96T88

UHRF1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF1Q96T88 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
UHRF1Q96T88 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
UHRF1Q96T88 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UHRF1Q96T88 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UHRF1Q96T88 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
UHRF1Q96T88 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UHRF1Q96T88 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UHRF1Q96T88 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UHRF1Q96T88 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
UHRF1Q96T88 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UHRF1Q96T88 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UHRF1Q96T88 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UHRF1Q96T88 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UHRF1Q96T88 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.32■■□□□ 1
UHRF1Q96T88 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UHRF1Q96T88 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UHRF1Q96T88 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
UHRF1Q96T88 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
UHRF1Q96T88 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
UHRF1Q96T88 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UHRF1Q96T88 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
UHRF1Q96T88 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UHRF1Q96T88 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.32■■□□□ 1
UHRF1Q96T88 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.32■■□□□ 1
UHRF1Q96T88 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UHRF1Q96T88 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
UHRF1Q96T88 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
UHRF1Q96T88 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC21.31■■□□□ 1
UHRF1Q96T88 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UHRF1Q96T88 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
UHRF1Q96T88 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UHRF1Q96T88 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
UHRF1Q96T88 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.31■■□□□ 1
UHRF1Q96T88 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC21.31■■□□□ 1
UHRF1Q96T88 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
UHRF1Q96T88 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
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