Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB3

PPP1R9B, Neurabin-2, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R9BQ96SB3 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP1R9BQ96SB3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP1R9BQ96SB3 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP1R9BQ96SB3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP1R9BQ96SB3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP1R9BQ96SB3 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP1R9BQ96SB3 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP1R9BQ96SB3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP1R9BQ96SB3 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP1R9BQ96SB3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PPP1R9BQ96SB3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP1R9BQ96SB3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP1R9BQ96SB3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP1R9BQ96SB3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP1R9BQ96SB3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP1R9BQ96SB3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP1R9BQ96SB3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP1R9BQ96SB3 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP1R9BQ96SB3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP1R9BQ96SB3 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP1R9BQ96SB3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP1R9BQ96SB3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP1R9BQ96SB3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP1R9BQ96SB3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP1R9BQ96SB3 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP1R9BQ96SB3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP1R9BQ96SB3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP1R9BQ96SB3 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP1R9BQ96SB3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP1R9BQ96SB3 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP1R9BQ96SB3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PPP1R9BQ96SB3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1R9BQ96SB3 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1R9BQ96SB3 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1R9BQ96SB3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1R9BQ96SB3 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1R9BQ96SB3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1R9BQ96SB3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1R9BQ96SB3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1R9BQ96SB3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1R9BQ96SB3 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1R9BQ96SB3 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1R9BQ96SB3 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1R9BQ96SB3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1R9BQ96SB3 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1R9BQ96SB3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1R9BQ96SB3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1R9BQ96SB3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1R9BQ96SB3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1R9BQ96SB3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1R9BQ96SB3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1R9BQ96SB3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1R9BQ96SB3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1R9BQ96SB3 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1R9BQ96SB3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PPP1R9BQ96SB3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP1R9BQ96SB3 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP1R9BQ96SB3 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP1R9BQ96SB3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP1R9BQ96SB3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP1R9BQ96SB3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP1R9BQ96SB3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP1R9BQ96SB3 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP1R9BQ96SB3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP1R9BQ96SB3 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP1R9BQ96SB3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP1R9BQ96SB3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP1R9BQ96SB3 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP1R9BQ96SB3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP1R9BQ96SB3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP1R9BQ96SB3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PPP1R9BQ96SB3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PPP1R9BQ96SB3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms