Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX18Q96RF0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX18Q96RF0 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX18Q96RF0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX18Q96RF0 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX18Q96RF0 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX18Q96RF0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX18Q96RF0 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX18Q96RF0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX18Q96RF0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX18Q96RF0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX18Q96RF0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX18Q96RF0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX18Q96RF0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX18Q96RF0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX18Q96RF0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX18Q96RF0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX18Q96RF0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX18Q96RF0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX18Q96RF0 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX18Q96RF0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX18Q96RF0 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX18Q96RF0 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX18Q96RF0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SNX18Q96RF0 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNX18Q96RF0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNX18Q96RF0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNX18Q96RF0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SNX18Q96RF0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX18Q96RF0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms