Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
TRAPPC9Q96Q05 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms