Protein–RNA interactions for Protein: Q96NF6

C8orf49, Putative uncharacterized protein C8orf49, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8orf49Q96NF6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
C8orf49Q96NF6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms