Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
FGD4Q96M96 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FGD4Q96M96 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms