Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM47Q96LD4 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRIM47Q96LD4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms