Protein–RNA interactions for Protein: Q96JW4

SLC41A2, Solute carrier family 41 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A2Q96JW4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC41A2Q96JW4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms