Protein–RNA interactions for Protein: Q96J77

TPD52L3, Tumor protein D55, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPD52L3Q96J77 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
TPD52L3Q96J77 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
TPD52L3Q96J77 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms