Protein–RNA interactions for Protein: Q96GM5

SMARCD1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD1Q96GM5 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SMARCD1Q96GM5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMARCD1Q96GM5 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMARCD1Q96GM5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMARCD1Q96GM5 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMARCD1Q96GM5 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMARCD1Q96GM5 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMARCD1Q96GM5 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMARCD1Q96GM5 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMARCD1Q96GM5 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMARCD1Q96GM5 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMARCD1Q96GM5 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SMARCD1Q96GM5 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMARCD1Q96GM5 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMARCD1Q96GM5 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMARCD1Q96GM5 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMARCD1Q96GM5 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMARCD1Q96GM5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMARCD1Q96GM5 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMARCD1Q96GM5 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms