Protein–RNA interactions for Protein: Q96GE6

CALML4, Calmodulin-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALML4Q96GE6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALML4Q96GE6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALML4Q96GE6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALML4Q96GE6 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALML4Q96GE6 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CALML4Q96GE6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALML4Q96GE6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CALML4Q96GE6 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALML4Q96GE6 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CALML4Q96GE6 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALML4Q96GE6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALML4Q96GE6 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALML4Q96GE6 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALML4Q96GE6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALML4Q96GE6 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALML4Q96GE6 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALML4Q96GE6 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALML4Q96GE6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALML4Q96GE6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALML4Q96GE6 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALML4Q96GE6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CALML4Q96GE6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALML4Q96GE6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CALML4Q96GE6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALML4Q96GE6 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALML4Q96GE6 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALML4Q96GE6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALML4Q96GE6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALML4Q96GE6 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALML4Q96GE6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALML4Q96GE6 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CALML4Q96GE6 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALML4Q96GE6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALML4Q96GE6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALML4Q96GE6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALML4Q96GE6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALML4Q96GE6 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALML4Q96GE6 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALML4Q96GE6 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALML4Q96GE6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALML4Q96GE6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALML4Q96GE6 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALML4Q96GE6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALML4Q96GE6 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALML4Q96GE6 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALML4Q96GE6 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CALML4Q96GE6 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALML4Q96GE6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALML4Q96GE6 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALML4Q96GE6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CALML4Q96GE6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CALML4Q96GE6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALML4Q96GE6 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALML4Q96GE6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALML4Q96GE6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALML4Q96GE6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALML4Q96GE6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALML4Q96GE6 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALML4Q96GE6 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALML4Q96GE6 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALML4Q96GE6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALML4Q96GE6 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALML4Q96GE6 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALML4Q96GE6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALML4Q96GE6 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALML4Q96GE6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALML4Q96GE6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALML4Q96GE6 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CALML4Q96GE6 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALML4Q96GE6 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALML4Q96GE6 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALML4Q96GE6 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALML4Q96GE6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CALML4Q96GE6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CALML4Q96GE6 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CALML4Q96GE6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CALML4Q96GE6 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CALML4Q96GE6 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CALML4Q96GE6 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CALML4Q96GE6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CALML4Q96GE6 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CALML4Q96GE6 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CALML4Q96GE6 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CALML4Q96GE6 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CALML4Q96GE6 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CALML4Q96GE6 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CALML4Q96GE6 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CALML4Q96GE6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CALML4Q96GE6 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CALML4Q96GE6 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CALML4Q96GE6 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CALML4Q96GE6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CALML4Q96GE6 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CALML4Q96GE6 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CALML4Q96GE6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CALML4Q96GE6 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CALML4Q96GE6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CALML4Q96GE6 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CALML4Q96GE6 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CALML4Q96GE6 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms