Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SMIM12Q96EX1 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.3 ms