Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM63Q969Q1 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM63Q969Q1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM63Q969Q1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM63Q969Q1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM63Q969Q1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM63Q969Q1 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM63Q969Q1 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM63Q969Q1 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM63Q969Q1 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM63Q969Q1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM63Q969Q1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM63Q969Q1 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM63Q969Q1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM63Q969Q1 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM63Q969Q1 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM63Q969Q1 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM63Q969Q1 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM63Q969Q1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM63Q969Q1 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM63Q969Q1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM63Q969Q1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM63Q969Q1 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
TRIM63Q969Q1 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM63Q969Q1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM63Q969Q1 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM63Q969Q1 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM63Q969Q1 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM63Q969Q1 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM63Q969Q1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM63Q969Q1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM63Q969Q1 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM63Q969Q1 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM63Q969Q1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM63Q969Q1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM63Q969Q1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM63Q969Q1 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM63Q969Q1 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM63Q969Q1 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM63Q969Q1 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM63Q969Q1 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM63Q969Q1 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM63Q969Q1 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM63Q969Q1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM63Q969Q1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM63Q969Q1 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
TRIM63Q969Q1 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM63Q969Q1 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM63Q969Q1 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM63Q969Q1 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM63Q969Q1 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM63Q969Q1 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM63Q969Q1 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM63Q969Q1 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM63Q969Q1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM63Q969Q1 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM63Q969Q1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM63Q969Q1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM63Q969Q1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM63Q969Q1 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM63Q969Q1 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM63Q969Q1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM63Q969Q1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM63Q969Q1 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM63Q969Q1 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM63Q969Q1 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
TRIM63Q969Q1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TRIM63Q969Q1 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
TRIM63Q969Q1 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM63Q969Q1 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM63Q969Q1 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM63Q969Q1 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM63Q969Q1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM63Q969Q1 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM63Q969Q1 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM63Q969Q1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM63Q969Q1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM63Q969Q1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM63Q969Q1 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM63Q969Q1 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM63Q969Q1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM63Q969Q1 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM63Q969Q1 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM63Q969Q1 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM63Q969Q1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM63Q969Q1 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM63Q969Q1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM63Q969Q1 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM63Q969Q1 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM63Q969Q1 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM63Q969Q1 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
TRIM63Q969Q1 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM63Q969Q1 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM63Q969Q1 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM63Q969Q1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM63Q969Q1 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM63Q969Q1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM63Q969Q1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM63Q969Q1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
TRIM63Q969Q1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms