Protein–RNA interactions for Protein: Q92752

TNR, Tenascin-R, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRQ92752 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TNRQ92752 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TNRQ92752 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TNRQ92752 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TNRQ92752 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TNRQ92752 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNRQ92752 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNRQ92752 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNRQ92752 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNRQ92752 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNRQ92752 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNRQ92752 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNRQ92752 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNRQ92752 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNRQ92752 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
TNRQ92752 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNRQ92752 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNRQ92752 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNRQ92752 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
TNRQ92752 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TNRQ92752 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TNRQ92752 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TNRQ92752 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TNRQ92752 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
TNRQ92752 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
TNRQ92752 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TNRQ92752 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
TNRQ92752 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNRQ92752 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNRQ92752 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNRQ92752 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNRQ92752 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
TNRQ92752 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNRQ92752 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNRQ92752 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNRQ92752 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
TNRQ92752 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNRQ92752 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNRQ92752 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNRQ92752 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNRQ92752 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNRQ92752 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNRQ92752 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
TNRQ92752 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNRQ92752 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNRQ92752 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
TNRQ92752 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TNRQ92752 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TNRQ92752 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TNRQ92752 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TNRQ92752 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TNRQ92752 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TNRQ92752 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
TNRQ92752 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TNRQ92752 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
TNRQ92752 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TNRQ92752 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TNRQ92752 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TNRQ92752 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TNRQ92752 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TNRQ92752 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
TNRQ92752 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TNRQ92752 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
TNRQ92752 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
TNRQ92752 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TNRQ92752 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
TNRQ92752 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TNRQ92752 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TNRQ92752 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TNRQ92752 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TNRQ92752 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
TNRQ92752 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
TNRQ92752 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.28
TNRQ92752 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.28
TNRQ92752 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
TNRQ92752 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
TNRQ92752 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
TNRQ92752 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNRQ92752 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNRQ92752 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNRQ92752 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNRQ92752 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNRQ92752 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNRQ92752 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNRQ92752 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNRQ92752 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNRQ92752 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNRQ92752 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNRQ92752 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
TNRQ92752 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
TNRQ92752 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
TNRQ92752 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNRQ92752 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNRQ92752 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNRQ92752 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNRQ92752 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
TNRQ92752 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNRQ92752 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
TNRQ92752 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TNRQ92752 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms