Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
TAF4BQ92750 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TAF4BQ92750 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms