Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
UBXN4Q92575 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
UBXN4Q92575 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms