Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF0

SRSF12, Serine/arginine-rich splicing factor 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF12Q8WXF0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRSF12Q8WXF0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms