Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DCAF4Q8WV16 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DCAF4Q8WV16 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms