Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUW1

BRK1, Protein BRICK1, humanhuman

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRK1Q8WUW1 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
BRK1Q8WUW1 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
BRK1Q8WUW1 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms