Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEJ3

SH3RF3, SH3 domain-containing RING finger protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3RF3Q8TEJ3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SH3RF3Q8TEJ3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SH3RF3Q8TEJ3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms