Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBY8

PMFBP1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMFBP1Q8TBY8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PMFBP1Q8TBY8 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PMFBP1Q8TBY8 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms