Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEW7

TMIE, Transmembrane inner ear expressed protein, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIEQ8NEW7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMIEQ8NEW7 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TMIEQ8NEW7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMIEQ8NEW7 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMIEQ8NEW7 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMIEQ8NEW7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMIEQ8NEW7 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMIEQ8NEW7 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMIEQ8NEW7 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMIEQ8NEW7 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMIEQ8NEW7 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMIEQ8NEW7 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
TMIEQ8NEW7 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMIEQ8NEW7 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMIEQ8NEW7 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMIEQ8NEW7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMIEQ8NEW7 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMIEQ8NEW7 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMIEQ8NEW7 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMIEQ8NEW7 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TMIEQ8NEW7 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMIEQ8NEW7 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMIEQ8NEW7 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMIEQ8NEW7 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TMIEQ8NEW7 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMIEQ8NEW7 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMIEQ8NEW7 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMIEQ8NEW7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMIEQ8NEW7 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMIEQ8NEW7 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMIEQ8NEW7 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TMIEQ8NEW7 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMIEQ8NEW7 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMIEQ8NEW7 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMIEQ8NEW7 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMIEQ8NEW7 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMIEQ8NEW7 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMIEQ8NEW7 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TMIEQ8NEW7 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TMIEQ8NEW7 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
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TMIEQ8NEW7 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TMIEQ8NEW7 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
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