Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP7

KLHDC9, Kelch domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC9Q8NEP7 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
KLHDC9Q8NEP7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
KLHDC9Q8NEP7 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms