Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
DTX3Q8N9I9 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms