Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
LINC00612Q8N6U2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.27□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00612Q8N6U2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms